有权检查手机的部门主要是 公安部门。根据《公安机关办理刑事案件程序规定》第二百六十三条，公安机关在立案后，根据侦查犯罪的需要，可以采取技术侦查措施，其中包括对手机进行检查。此外，在涉及国家安全犯罪或刑事犯罪时，权利机关如纪委和监委也可依法查验手机，但这通常需要遵循严格的审批流程和规章制度。
总结来说，以下是有关检查手机权限的要点：
公安部门：
在立案后，公安机关有权对涉嫌犯罪的案件采取技术侦查措施，包括检查手机。
纪委和监委：
在涉及刑事和国家安全犯罪时，这些部门也有权查验手机，但需遵循层层审批的流程。
其他部门：
如海关，在特定情况下（如国家安全需要）也可能获得检查手机的权利。
建议在需要检查手机时，相关执法部门应严格按照法律规定和程序进行，以保护公民的隐私权和通信自由。