在多个网店系统中，以下几个手机应用程序因其功能、用户评价和市场份额而脱颖而出：
Hishop移动云商城
特点：Hishop移动云商城是一个真正的六合一商城，支持手机网上商城建设，功能强大且易于使用。
优势：该系统不仅提供了丰富的功能和模板，还支持快速上手和独立手机网站的建设，适合企业主节省时间和资本。
店宝宝
特点：适合在淘宝开店，具有易用性，包括开店、管理和发货等功能。
优势：店宝宝虽然上线时间不长，但其优势已经显现，适合需要快速开店和便捷管理的用户。
千牛淘宝卖家版
特点：淘宝官方出品的卖家移动工作平台，功能模块包括卖家工作台、旺旺卖家版、消息中心和插件中心。
优势：支持手机和电脑同时在线，方便用户随时随地管理店铺，非常适合淘宝卖家。
美团开店宝手机版
特点：美团商家平台推出的手机应用程序，支持商家在移动设备上进行店铺管理。
优势：美团开店宝适用于美团平台的商家，具有便捷的管理和操作功能。
萌店
特点：一个免费的开源网店系统，适合个人和小企业快速构建个性化网上商店。
优势：萌店虽然是一个新兴的平台，但其简洁的设计和易用性已经获得了用户的认可。
ECShop
特点：一款B2C独立网店系统，完全免费开源，适合快速构建个性化网上商店。
优势：ECShop拥有丰富的模板和内页设计，适合需要个性化设计的商家。
根据以上信息，如果您是打算在淘宝或其他平台上开设网店，并且需要功能全面、易于使用的系统， Hishop移动云商城和 店宝宝是不错的选择。如果您是美团平台的商家， 千牛淘宝卖家版和 美团开店宝手机版则更为适用。对于个人和小企业， 萌店和 ECShop作为开源系统，也是一个值得考虑的方案。
建议您根据自己的具体需求和操作习惯，选择最适合自己的网店系统。