计算机指令是由 计算机程序发出的。程序是由一系列按一定顺序排列的指令组成，当执行程序时，这些指令会被一条一条地执行。具体来说，计算机指令是指挥机器工作的指示和命令，程序就是一系列按一定顺序排列的指令，执行程序的过程就是计算机的工作过程。在编程中，程序员通过编写代码来发出指令，控制计算机的行为。指令集是CPU中用来计算和控制计算机系统的一套指令的集合，每种新型的CPU在设计时就规定了一系列与其他硬件电路相配合的指令集。
总结来说，计算机指令的发出是通过计算机程序来实现的，程序中的指令按顺序执行，从而指挥计算机完成各种操作。