计算机指令系统，也称为 计算机指令集，是指 一台计算机中所有机器指令的集合。它是表征一台计算机性能的重要因素，其格式与功能不仅直接影响到机器的硬件结构，也直接影响到系统软件，以及机器的适用范围。
具体来说，指令系统是计算机硬件的语言系统，也叫机器语言。它是软件和硬件的主要界面，从系统结构的角度看，它是系统程序员看到的计算机的主要属性。不同计算机的指令系统包含的指令种类和数目也不同。指令系统包括指令格式、寻址方式和数据形式。一台计算机的指令系统反映了该计算机的全部功能，机器类型不同，其指令系统也不同，因而功能也不同。指令系统的设置和机器的硬件结构密切相关，一台计算机要有较好的性能，必须设计功能齐全、通用性强、内含丰富的指令系统，这就需要复杂的硬件结构来支持。
常见的指令集有：Intel的x86，EM64T，MMX，SSE，SSE2，SSE3，SSSE3 （Super SSE3），SSE4A，SSE4.1，SSE4.2，AVX，AVX2，AVX-512，VMX等指令集；和AMD的x86，x86-64，3D-Now!指令集。