计算机指令结构通常 由操作码和操作数两部分组成。操作码指明指令要完成的操作类型或性质，如取数、做加法或输出数据等。操作数则指参加运算的数据及其所在的存储单元地址。这两部分通过二进制数码表示，并共同构成一条指令，以二进制编码的形式存放在存储器中。
具体来说，指令是指挥机器工作的指示和命令，程序是由一系列按一定顺序排列的指令组成，执行程序的过程就是计算机的工作过程。控制器靠指令指挥机器工作，人们用指令表达自己的意图，并交给控制器执行。一台计算机所能执行的各种不同指令的全体，叫做计算机的指令系统，每一台计算机均有自己的特定的指令系统，其指令内容和格式有所不同。
此外，指令还可以包括其他组成部分，如地址码、立即数、寄存器名或寄存器编号等。根据指令长度和格式的不同，指令结构可以有不同的分类，如定长指令结构和变长指令结构。指令集是CPU中用来计算和控制计算机系统的一套指令的集合，每种新型的CPU在设计时就规定了一系列与其他硬件电路相配合的指令集。