中国科学院计算技术研究所
创建于1956年，是中国第一个专门从事计算机科学技术综合性研究的学术机构。招聘专业方向包括处理器、计算机系统、网络、大数据、人工智能等，招聘学科方向包括但不限于计算机科学与技术、电子信息、信息与通信工程、电子科学与技术、网络空间安全、控制科学与工程、数学、生物医学工程等。
中国兵器工业计算机应用技术研究所
位于北京市海淀区车道沟10号院，招聘专业包括计算机、软件工程、控制科学与工程、信息与通信工程、电子信息相关专业。提供硕士和博士岗位，薪酬极具竞争力，硕士20-40万，博士40-60万。
北京计算机技术及应用研究所
隶属于中国航天科工集团公司，是国内最具实力的特种计算机研究所之一。拥有多个专业硕士学位授予点，包括计算机系统结构、计算机应用技术、计算机软件与理论、计算数学、控制理论与控制工程等。招聘专业方向包括计算机科学与技术、软件工程等。
中国电子科技集团公司第十四研究所
是中电科技的核心研究机构之一，涵盖了计算机科学与技术、软件工程等相关领域。
中国电子科技集团公司第二十八研究所
主要从事信息系统集成、软件开发、网络与通信等方面的研究和应用。
中国电子科技集团公司第五十四研究所
主要从事信息安全、网络与通信、软件工程等方面的研究和应用。
其他研究所
北京机械工业自动化研究所、中国工程物理研究院、华北计算机系统工程研究所、华北计算技术研究所、中国航天科技集团公司第一研究院等也招收计算机专业学生。
建议根据个人学术背景和职业规划，选择合适的研究所进行申请。