计算机只存补码的原因主要有以下几点：
简化硬件结构：
计算机内部处理器通常只设置了加法处理器，没有减法处理器。为了进行减法运算，计算机需要将减法转化为加法，这涉及到补码的概念。使用补码可以使得加法和减法运算使用相同的硬件电路，从而简化了硬件设计。
统一处理符号位和数值位：
补码将符号位和数值位统一处理，使得加法和减法运算可以统一进行。在补码表示法中，正数的补码与其原码相同，而负数的补码是其反码加1。这种表示方法有效地解决了0的符号问题，使得0只有一种表示方式，避免了在运算中处理+0和-0的问题。
提高运算速度：
由于补码的使用，计算机可以直接将减法运算转化为加法运算，从而提高了运算速度。这种转化过程不需要额外的硬件电路，进一步简化了计算机的结构设计。
避免双重零表示：
在补码表示法中，0只有一种表示方式，即所有位都为0。这避免了在原码表示法中存在的+0和-0的双重零表示问题，简化了运算过程。
综上所述，计算机只存补码是为了简化内部结构、统一处理符号和数值、提高运算速度，并避免双重零表示的问题。这种编码方式在计算机系统中得到了广泛应用。