指令系统，也称为机器指令集，是指 计算机所能执行的全部指令的集合。它描述了计算机内全部的控制信息和“逻辑判断”能力。指令系统是计算机硬件的语言系统，也称为机器语言，是软件和硬件之间的主要界面。从系统结构的角度看，指令系统是系统程序员看到的计算机的主要属性。
指令系统包括各种类型的指令，如算术运算型、逻辑运算型、数据传送型、判定和控制型、移位操作型、位（位串）操作型、输入和输出型等。不同的计算机系统具有不同的指令系统，这些指令系统的格式和功能直接影响到机器的硬件结构和系统软件的设计，从而也决定了机器的适用范围。
在设计指令系统时，需要考虑指令的功能、类型、格式、寻址方式以及数据形式等多个方面。指令系统的性能直接关系到计算机的基本功能和用户体验，因此，设计一个功能齐全、通用性强且内含丰富指令的系统是非常重要的。常见的指令集有Intel的x86、EM64T、MMX、SSE、SSE2、SSE3、SSSE3、SSE4A、SSE4.1、SSE4.2、AVX、AVX2、AVX-512、VMX等，以及AMD的x86、x86-64、3D-Now!等。