工程财务分析程序通常包括以下几个步骤：
建设投资估算
确定土建工程、设备购置安装工程的内容与数量单价。
确定产品消耗定额
单位产品消耗原材料、辅料、运杂费、燃动力费用。
劳动定员
确定用工数量、工资标准、附加养老金等比例，工作制度，按定员确定生活用水量。
产品生产成本估算
单位产品生产成本和年生产成本、增值税进项税。
确定贷款情况
是否贷款、贷款数额、时间、利息，以及用于建设投入和流动资金投入的金额。
估算银行贷款还本付息表。
估算固定资产折旧及摊销
包括无形、递延、建设期利息等摊销。
估算项目经营年总成本
总成本=固定成本+可变成本，其中固定成本包括总部成本—原材料和燃料动力=劳动定员工资工资附加+折旧+摊销（递延无形）+维修+租金+其它费用（销售额10%）+建设期利息摊销；可变成本=外购原辅料及运杂费+燃动力费用（生产消耗的一切）；经营成本=总成本费—折旧费、摊销费、贷款利息。
估算销售收入
包括销项税、进项税、应缴增值税、税金及附件。
估算流动资金
流动资金需求量的计算。
编制相关表格
总投资构成分析表、投资计划和资金筹措表、利润及利润分配表、财务计划现金流量表、项目投资现金流量表、项目资本金现金流量表、资产负债表、财务预测与效益分析汇总表。
财务分析与预测
通过趋势分析法、比率分析法、因素分析法等财务分析方法，对企业的财务状况、经营成果和现金流量进行详细分析，并预测未来的发展趋势。
撰写分析报告
根据分析结果撰写财务分析报告，提出改进建议和投资决策。
这些步骤涵盖了从项目初期投资估算到后期财务分析与预测的全过程，旨在确保项目的财务可行性和盈利能力。