招标程序存在以下缺点：
竞争激烈：
由于招标涉及多个供应商之间的竞争，参与招标的供应商数量较多，激烈的竞争可能降低供应商的利润空间，导致供应商不愿意参与招标，影响资源的供给。
时间和成本：
招标程序繁琐，需要大量的时间和人力物力的投入。对于市场需求较紧张的采购需求，招标的时间和流程可能成为制约因素。
不一定满足采购需求：
招标过程中需要考虑多种因素（如价格、质量、服务等），并根据需求者指定的标准筛选，可能导致某些产品并没有满足需求者的采购需求。
招标工作量大、时间较长：
程序和手续较为复杂，耗费时间。对所有潜在供应商的资信了解程序不一，投标单位良莠不齐，容易被不负责任的单位抢标。
供应商可能把各种手续及押金的负担附加在成本之内：
增加采购成本。
可能发生高价围标或低价抢标的情况：
导致采购成本增加，影响项目的经济效益。
信息不对称：
在公开招标过程中，供应商可能无法获得完整和准确的信息，从而导致投标方案的质量和准确性受到影响。
存在风险：
恶意哄抬标价或低价中标后高价结算等情况可能给招标人带来风险。招标文件编制可能存在问题，如与工程实际需求不符或与相关法律法规政策的偏离。
弄虚作假的风险：
一些企业可能会为了达到中标目的，使用不恰当的手段，如招标材料弄虚作假、故意给出价格很低的报价等，给工程留下安全质量隐患。
规避招标：
某些建筑单位对工程建设招投标认识不足，规避招标，逃避相关部门的监督与管理。
贿赂评委：
招标单位与评委之间可能存在贿赂行为，影响招标的公正性。
泄露标底：
标底的泄露可能导致不公平竞争，影响招投标结果的公正性。
明招暗定：
表面上进行形式上的招投标，私下与既定建设单位确定关系，进行暗箱操作。
这些缺点表明，虽然招标程序具有公开、公平、公正等优点，但在实际操作中仍存在不少问题和挑战，需要进一步完善和改进。