自动脱党的程序主要包括以下几个步骤：
认定自行脱党条件
党员如果没有正当理由，连续六个月不参加党的组织生活，或不交纳党费，或不做党所分配的工作，就被认为是自行脱党。
调查核实
党支部委员会在提交支部大会讨论之前，应对自行脱党的党员进行认真调查研究，查清原因，并提出处理意见，然后如实向支部大会报告。
支部大会讨论
支部大会应通知本人参加并允许申辩。如果本人长期外出不归或拒不参加会议，支部大会仍可讨论处理问题。经过讨论，如认定属于自行脱党者，应作出除名的决定。
报上级党组织批准
支部大会的决定需要报上级党组织批准。上级党组织在接到报告后，应进行审核并批准除名决定。
宣布除名
上级党组织批准后，党支部应宣布对自行脱党的党员进行除名，并备案。
这些步骤旨在确保党员自行脱党的处理过程公正、透明，并严格按照党章规定执行。