竣工结算的程序主要包括以下几个步骤：
资料收集与整理
施工单位需收集完整的竣工图纸，确保其准确反映工程实际完成情况，标注所有设计变更与修改内容。
施工合同及补充协议是核心依据，明确了双方的权利义务、计价方式、风险分担等条款。
工程变更签证单必须齐全且经过各方有效签字盖章，详细记录变更原因、内容及增减工程量。
材料设备采购发票与清单用于核实成本，同时，施工日志、隐蔽工程验收记录等资料也不可或缺。
工程量核对
造价师依据竣工图纸和变更签证，按照工程量计算规则，对各分部分项工程进行精确核算。
对于复杂部位，如地下室、转换层等，更要深入分析，结合现场实际情况确定工程量。
若建设单位与施工单位对工程量存在争议，应依据合同约定的解决方式，如协商、第三方鉴定等进行处理。
费用计算与调整
根据合同约定的计价方式计算工程费用。
对于固定总价合同，重点关注变更部分的费用调整；单价合同则需重新核算工程量与单价乘积。
计算公式为：竣工结算工程价款 = 预算或合同价款 + 施工过程中预算或合同价款调整数额 - 预付及已结算工程价款 - 质量保证（保修）金。
变更管理
变更是指在施工过程中因设计变更、施工条件变化等原因导致的工程量或价格的调整。
变更管理是竣工结算中的重要环节，需要严格按照合同约定和相关规范进行。
变更的处理需要依据《建设工程工程量清单计价规范》（GB50500--2013）等相关规定。
签证
签证是施工过程中对合同价款之外的责任事件所作的签认证明，通常以技术核定单和业务联系单的形式出现。
整体流程
工程验收：由建设单位组织对工程项目进行全面检查、测试和评估，确认工程质量符合规定标准，并形成验收报告。
工程量核算：根据实际工程量和合同单价计算工程费用，核对工程项目中的各项实际工程量，并与合同约定的工程单价相乘，计算出各项工程费用，并形成工程结算表。
工程质量评定：对工程项目的质量进行全面检查，包括结构安全性、设计规范性、设备运行稳定性等方面。
工程费用结算：依据核算的工程量和质量评定结果，进行最终的工程费用结算。
提交与审核
承包人应在提交竣工验收报告的同时，向发包人递交竣工结算报告及完整的结算资料。
发包人应在收到竣工结算报告及结算资料后28天内进行核实，给予确认或者提出修改意见。
发包人确认竣工结算报告后通知经办银行向承包方支付工程竣工结算价款。
承包方收到竣工结算价款后14天内将竣工工程交付发包方。
争议解决
发包方和承包方对工程竣工结算价款发生争议时，按争议的约定处理。
若发承包双方对复核结果无异议的，应在7天内在竣工结算文件上签字确认，竣工结算办理完毕。
若发包人或承包人对复核结果认为有误的，无异议部分按照上述规定办理不完全竣工结算；有异议部分由发承包双方协商解决；协商不成的，按照合同约定的争议解决方式处理。
以上步骤构成了竣工结算的完整流程，确保工程价款结算的准确性和公正性。