刑事诉讼适用的程序主要包括以下阶段：
立案
立案是指公安机关、人民检察院、人民法院对报案、控告、举报和犯罪人的自首等方面的材料进行审查，判明是否有犯罪事实并需要追究刑事责任，依法决定是否作为刑事案件交付侦查或审判的诉讼活动。
侦查
侦查是指由特定的司法机关（主要是公安机关和检察院）为收集、查明、证实犯罪和缉获犯罪人而依法采取的专门调查工作和有关的强制性措施。侦查措施包括讯问犯罪嫌疑人、询问证人、勘验、检查、搜查、扣押物证、书证、组织鉴定、发布通缉令等。
审查起诉
审查起诉是指人民检察院接到侦查机关移送的案件后，对《起诉意见书》以及全部案卷材料和证据进行全面审查，讯问犯罪嫌疑人，听取被害人和犯罪嫌疑人、被害人委托人的意见，调查核实其他证据，决定是否提起公诉。若认为案件事实不清、证据不足，可以决定退回侦查机关补充侦查。
审判
审判是指人民法院在控、辩双方及其他诉讼参与人参加下，依照法定的权限和程序，对于依法向其提出诉讼请求的刑事案件进行审理和裁判的诉讼活动。审判程序包括一审程序、二审程序、死刑复核程序等。法院审判第一审案件一般应当公开进行，但否当庭宣判则视法庭审理情况及结果而定。
执行
执行是指刑事执行机关（主要是人民法院、公安机关和监狱）实施已经发生法律效力的判决和裁定所确定的内容，包括对罪犯的刑罚执行（如监禁、罚金等）。
特别程序
特别程序是指针对特定类型的刑事案件所设立的程序，如未成年人刑事案件诉讼程序、当事人和解的公诉案件诉讼程序、缺席审判程序、犯罪嫌疑人、被告人逃匿、死亡案件违法所得的没收程序、依法不负刑事责任的精神病人的强制医疗程序等。
这些程序共同构成了刑事诉讼的完整框架，确保了案件的公正、合法、有效处理。