程序合法的程序指的是 符合法律规定的程序，具体可以从以下几个方面进行理解：
符合编程语言规范：
程序在语法和语义上都应遵守编程语言的规范，没有语法和语义错误，能够正确完成预期功能。
遵守法律法规：
程序在开发和使用过程中必须遵守相关的法律法规，包括但不限于版权法、专利法、商标法等知识产权法律法规，以及计算机软件保护条例、计算机信息系统安全保护条例等。
民主程序制定：
对于某些规章制度，如用人单位的规章制度，其制定过程必须通过民主程序，如职代会或职工大会等，并且不违反国家法律、行政法规及政策规定。
合法性和合规性：
程序在编写和执行过程中要确保合法性和合规性，不侵犯他人的知识产权，同时保护信息系统的安全。
正当法律程序：
在行政法领域，程序要求中立、参与及公开，确保法律行为的正当性。
综上所述，程序合法不仅要求程序在技术和操作层面符合规范，还要求在法律层面得到认可和保护。程序合法是程序正确性、可靠性的基础，也是程序正常运行和开发过程有效性的关键。