辞职副科职务的程序如下：
提交辞职申请
向所在单位提交书面辞职申请，说明辞职原因及未来去向。
等待审核与批准
单位领导或组织部门对辞职申请进行审核，并决定是否同意辞职。
若需进一步审查，如经济责任审计等，相关部门将进行调查。
办理档案和工资关系转移
填写相关表格并盖章审批，然后到原单位调出档案，并将档案交人社局查阅验证。
办理工资关系转出手续，并确保所有手续办理完毕。
获取介绍信
到原单位开具介绍信，以便到新单位报到。
到新单位报到
携带介绍信到当地人社局，将档案调入新单位的主管人社局，并由新单位开具介绍信以完成报到。
建议：
辞职过程可能较为复杂，建议提前了解并准备好所有相关材料。
与单位和组织部门保持良好沟通，确保每一步骤顺利进行。