在《源氏物语》中，藤壶女御的结局是 悲剧的。她最初作为女御受到桐壶帝的宠爱，后来因为生下了一位皇子（即后来的朱雀帝），逐渐晋升为藤壶皇后。然而，她与源氏之间的爱情却充满了曲折和痛苦。尽管他们彼此倾心，但由于身份和宫廷规矩的限制，他们始终无法真正相守。
藤壶女御在生下皇子后不久便去世了，她的去世给源氏带来了极大的打击和悲痛。此外，源氏后来还因为恋母情结，抢走了藤壶女御的侄女紫姬，使紫姬成为了他的禁脔，这一行为也进一步加剧了他的悲剧色彩。
因此，可以说藤壶女御在《源氏物语》中的结局是充满遗憾和悲哀的。她的爱情和人生经历不仅反映了当时宫廷生活的残酷和无情，也体现了作者对于人性、爱情和生命的深刻思考。