软件企业的成本核算方法可以归纳如下：
直接成本归集
对于各部门直接发生的成本费用，如领用的办公用品、员工工资等，进行直接归集。
共同承担费用分配
对于各部门共同承担的费用，如房租、水电管理费、电话费、清洁费等，按合计总工时分配到各部门。
项目成本统计
对于某项目的所花工时，按工作报告形式进行统计，并据此计算项目成本。
辅助部门成本分配
辅助部门发生成本费用的分配标准采取按某直接生产部门本月工时数占所有直接生产部门工时合计数的比例进行分配。
全局成本管理
采用全局成本核算方法，把总成本集中处理，以总成本的结果来表示，并进行总体的成本管理。
分项成本核算
基于分项成本的核算方法，将总成本按照不同的活动归类，划分出各项不同的成本，并分别进行成本核算。
活动成本核算
基于活动成本的核算方法，将总成本按照不同的活动划分，进行活动成本的核算。
成本核算软件选择
选择合适的成本核算软件，如用友畅捷通旗下的好会计或好生意，以提高成本核算的准确性和效率。
设立成本核算标准
根据企业实际情况制定合理的成本核算标准，包括材料成本、人工成本、制造费用等。
精细化管理成本
进行精细化管理成本，不断降低核算成本，提高经济效益，包括对成本进行细致的分析和评估，及时发现问题并采取相应措施。
软件辅助核算
利用信息化技术和大数据分析，提高核算的准确性和效率，降低人力成本。
项目核算
对于每个研发项目设置项目核算，参照生产企业成本核算设置“生产成本”科目，分别核算每个项目的成本，并在项目收入确认时结转软件成本。
成本结转
当软件出售时，结转相应成本；如果是成批或连续生产，则于每月底结转成本。
期间费用核算
大部分软件企业将软件开发过程中投入的人员工资、仪器设备及易耗费用均进入期间费用核算。
研发支出核算
研发支出分为费用化支出和资本化支出，费用化支出在月末转入管理费用，资本化支出则作为资产类科目。
通过以上方法，软件企业可以全面、准确地核算成本，从而有效控制成本水平，实现节约成本的目标。