软件销售退税的操作流程如下：
备案与开票
在电子税务局完成备案，填写基础信息并上传《软件产品登记证书》或《计算机软件著作权登记证书》。
规范开具软件销售合同，确保产品名称与登记证书中的名称一致，并使用“套”作为计量单位。
在开具发票时，添加商品编码，并清晰注明软件产品名称及版本号。
精准申报
在增值税纳税申报表主表的“即征即退项目”板块，准确填列软件销售的销售额、销项税额和进项税额。
备齐材料
税款入库后，准备退（抵）税申请审批表、退税申请报告等必备材料，确保资料格式规范、内容详实。
线上申请与追踪进度
登录电子税务局，进入“退（抵）税管理”模块，提交退税申请。
在“退（抵）税申请审批表”中填写必要信息，并选择“先征后退”的退税方式。
提交申请后，通过系统查询退税进度。
税务机关审核
税务机关将对申请材料进行审核，包括验证产品登记和核查税负情况。
审核通过后，税务部门将核定应退税款，并将超税负3%的部分退还至企业账户。
后续跟进
退税到账后，企业应做好财务记录，并随时与税务机关保持沟通，确保退税过程顺畅。
退税条件与金额计算
退税条件：增值税一般纳税人销售自行开发生产或本地化改造后的进口软件产品，按13%税率缴纳增值税后，对实际税负超过3%的部分可申请退税。
退税金额计算：即征即退税额 = 当期软件产品增值税应纳税额 - 当期软件产品销售额 × 3%。
注意事项
企业需确保所有退税申请材料的真实性和完整性，避免因资料问题影响退税进度。
在开具发票和申报增值税时，必须严格遵循相关税收政策和规定，确保数据准确无误。
退税申请提交后，应密切关注税务机关的审核进度，并及时响应任何补充材料或现场核查的要求。