保护公司软件项目可以从以下几个方面入手：
项目实施过程的监督和控制
在需求分析阶段和技术开发阶段，应进行有效的监督和控制，确保每个环节都得到把控，以便在项目出现问题时能够迅速反应和解决。
树立安全意识
项目人员应树立起安全意识，将安全融入开发过程中，确保软件项目的安全性。
软件著作权的保护
明确软件知识产权归属，尽早办理专利权登记，保护技术秘密，并在软件产品进入市场前进行著作权登记，防止他人抢先登记。
技术秘密的认定和保密措施
对软件产品或成果中的技术秘密采取保密措施，避免技术泄露，并在发生泄密时能够依法追究泄密行为人的法律责任。
商标权和商业信息的保护
对软件产品进行商标注册，保护商标专用权，防止他人恶意侵犯。
安全保障方案
制定包括安全需求分析、风险评估、安全设计在内的安全保障方案，并在实施过程中加强安全性控制和代码审查，及时发现和修复潜在的安全问题。
监控和改进
对软件运行过程进行安全监控，定期评估和改进安全保障方案，以适应不断变化的安全环境和威胁。
提供正版软件
向员工提供正版软件，并采取各种措施防止员工使用未经授权的软件，避免法律纠纷和麻烦。
内部保密制度
建立完善的保密制度，确保公司内部人员不会泄露商业秘密，并与外部人员（如供应商、顾问和外包人员）签订保密协议。
技术保护手段
采用加密、数字签名等技术手段，严格数据访问权限控制，部署防火墙、入侵检测系统等网络安全设备，防范网络攻击和数据泄露。
员工培训
提供全面的安全意识培训，教育员工有关数据保护的最佳实践和安全政策，确保员工了解如何处理敏感信息。
访问控制
实施严格的访问控制策略，仅授权人员可以访问关键代码库和开发环境，使用身份验证、角色基础的访问控制和多因素认证等技术来加强安全性。
定期审计
进行定期的安全审计，检查系统和网络中的漏洞和弱点，通过发现和修复潜在的安全问题，减少代码泄漏的风险。
物理安全措施
采取物理安全措施，确保公司数据资产的安全，防止未授权访问。
通过以上措施，可以有效保护公司软件项目，确保项目的安全性、知识产权和商业利益。