软件登记材料的修改流程如下：
准备材料
按照要求填写的变更或者补充申请表。
登记证书或者证明的复印件。
有关变更或者补充的材料。
提交申请
申请人应当与软件著作权登记人、转让合同、专有许可合同登记人一致。
变更或补充内容
软件名称变更的，应当提交纸质变更理由说明并签章，同时填写软件全称、简称、版本号等信息。
法人名称变更的，应当提交注册机关出具的名称变更证明原件或复印件。
审核与办理
申请材料提交后，登记机关受理并审核，从受理之日起30个工作日内完成变更或补充登记。
建议：
在进行软件登记材料的修改前，建议详细阅读相关法规，确保所有材料符合要求。
提前准备好所有必需的文件，并按照规定的流程进行提交，以确保变更或补充过程顺畅。