清除软件使用痕迹的方法如下：
常规卸载与深度清理
卸载软件通常只是移除了应用程序的文件，而系统级别的数据（如设置、缓存和登录信息）可能依然存在。
强制卸载与应用程序管理
对于一些顽固的应用，需要进行强制卸载（通常在设备管理员权限下进行）。
在Android设备上，启用“开发者选项”，然后选择“卸载包”。
iPhone则需使用第三方清理工具。
数据擦除
为了彻底清除，可以进行数据擦除，这将删除所有与应用相关的个人信息，包括云存储内容。
例如，iTunes的“备份与管理”里的“擦除备份数据”，或第三方清理工具如CCleaner。
浏览器清除
许多应用会通过浏览器存储数据，如Cookie和缓存。
定期清理浏览器缓存，或者使用隐私浏览模式，可以减少这部分痕迹。
隐私设置检查
需要定期检查应用权限，确保没有应用程序在没有你的许可下访问个人信息，如联系人、位置等。
使用第三方清理工具
如电脑管家、系统优化软件等，可以清理电脑浏览记录、软件使用记录、浏览器使用记录等。
清除临时文件夹中的内容
Windows系统和各类应用程序在运行时会产生临时文件，清理临时文件夹也是清除电脑使用痕迹的一个好办法。
恢复出厂设置
彻底删除手机里的所有使用痕迹，可以尝试恢复出厂设置并格式化SD卡（如果有的话）。
注意备份重要数据，因为此操作会删除所有数据。
重新安装操作系统
如果其他方法都无法彻底清除痕迹，可以考虑重新初始化手机，即恢复出厂设置，然后重新安装所需的软件。
建议根据个人需求和设备类型选择合适的方法，确保在清除痕迹前备份重要数据，以防数据丢失。