软件原创性的证明可以通过以下几种方式：
软件著作权登记证书
软件著作权登记证书是对软件开发者拥有软件原创性的一种法律证明，它确认了软件的创作者对其作品享有独占权利。
源代码审查
版权局进行形式审查时，会检查提交的源代码是否符合登记的形式要求，例如每页程序是否够50行，代码里面的版权声明是否清晰，以及软件版本信息等。
提交源代码
如果你需要证明软件是你自己独立开发的，可以向版权保护中心提交源代码，进行鉴定比对。在版权保护中心提交的源代码可以作为公开可信的源代码。
开发过程记录
提供开发过程的详细记录，如版本控制系统的日志、开发时间线、设计文档、用户手册等，以证明作品的原创性和创作成果。
第三方鉴定
可以借助专业的第三方鉴定机构或平台，通过比对源代码与公开资料，评估其原创性水平，并提供相应的相似度百分比。
时间戳认证
利用可信时间戳知识产权保护平台，对电子数据文件进行认证，确保文件的真实性和原创性。
学术搜索引擎
使用学术搜索引擎，如Google学术和百度学术，探查已发表的文章中是否有相似部分，以验证原创性。
原创检测工具
使用市面上的原创检测工具，如Turnitin和CopyScape，将文章与互联网中的内容对比，评估其原创性水平。
自建数据库
设立私人数据库，将已发布文章及相关素材输入其中，完成新作后，将其与库内内容进行比对，以迅速获得精确的原创度检测报告。
众包平台
利用众包平台，聚集志愿者进行文章原创度检测，获取更为精准且权威的原创鉴定结果。
通过上述方法，可以有效地证明软件的原创性，确保在出现软件著作权或技术秘密纠纷时，能够提供充分的证据来维护自身权益。