在Stata软件中进行多重比较，可以采用以下方法：
Bonferroni法
在oneway命令后加`bonferroni`选择项，即可得到经Bonferroni校正后的概率值。
Scheffe法
同样在oneway命令后加`scheffe`选择项，可以得到经Scheffe校正后的概率值。
Sidak法
在oneway命令后加`sidak`选择项，可以得到经Sidak校正后的概率值。
示例
假设有一个数据集`sysage.dta`，包含收缩压（systolic）、疾病种类（disease）、用药种类（drug）和年龄（age）四个变量。要使用Bonferroni法进行两两比较，可以使用以下命令：
```stata
onewaysystolicdrug, bonferroni
```
这将输出各药物组收缩压变化值的两两比较结果，并显示校正后的概率值。
注意事项
多重比较可能会增加假阳性率，因此在使用这些方法时应谨慎选择，并确保理解其假设和局限性。
对于被试内的数据，通常不能进行多重比较，只能对对被试间变量进行多重比较。
其他软件
除了Stata，还有其他软件可以用于多重比较，例如：
MAFFT：用于多重序列比对，虽然主要用于序列比对，但也可以用于多重比较的统计分析。
R：R语言中有丰富的统计包，如`TukeyHSD`、`glht`等，可以进行多重比较。
根据具体需求和数据类型，可以选择合适的软件和统计方法进行多重比较。