荧光图分析软件有多种,以下是针对不同软件的具体分析方法和步骤:
ImageJ Plot Profile工具:
用于定性表达共定位。通过在图像中划过感兴趣的区域,测量不同荧光通道的灰度值变化,从而判断两种荧光是否共定位。具体步骤包括打开待分析的RGB格式荧光图片,使用划线工具划线,选择Analyze > Plot Profile(快捷键Ctrl+K)得到灰度值变化图,并比较不同通道的变化情况。
Colocalization Finder插件:用于定量分析共定位情况。通过拆分荧光通道并使用该插件分析,得到共定位散点图和相关系数。步骤包括打开待分析图片,通过Image > Color > Split channels拆分通道,然后选择Plugins > Colocalization Finder分析共定位情况,并通过Plugins > 3D > Interactive 3D Surface Plot直观显示结果。
ScatterJ插件:用于共定位定量分析,提供散点图和相关系数等结果。
FIJI 荧光强度测定:
用于测量荧光强度并进行定量描述。步骤包括打开荧光细胞图片,拆分通道,选择阈值,测量荧光强度,并将结果相加以作图。
ZEN
荧光值提取: 用于提取图片中的荧光值。步骤包括打开图片,选择灰度分析,并查看荧光值。ImageJ(进阶操作)
转换为8bit灰度图: 将图片转换为8bit灰度图,并进行黑白反转,以便进行光密度校正。 光密度校正
Pannoramic viewer 查看荧光图片:
用于查看整张荧光图片,支持不同级别的放大,便于观察细节。
IPP
灰度转换和反转: 将荧光图片转换为灰度图并进行黑白反转。MoticFluo1.0
专业生物图像分析: 适用于细胞形态学分析、双重免疫荧光染色后荧光图像的叠加分析和细胞内离子比例测定等。具有强大的图像显示和输出功能。qPCR软件
荧光定量PCR数据分析:
用于基于高通量荧光定量PCR的数据分析,提供散点图、折线图、对比图和芯片图等多种结果分析图表。
根据具体需求和实验条件,可以选择合适的软件进行荧光图分析。ImageJ和FIJI是常用的图像处理软件,适合进行定性和定量分析;ZEN适用于荧光值的提取;而qPCR软件则专注于荧光定量PCR数据的分析。