科脉软件的盘点流程如下：
确认盘点
营运负责人与财务负责人确认盘点。
通知相关部门
在盘点日期到来前三天通知与盘点相关的各部门，如采购部、仓管部、信息部、卖场运营人员等。
处理业务
各部门将相关业务处理好，包括采购部停止订货、仓管停止收货、已做出货操作货物清理另行堆放、已做入库操作货物实物入库、信息部完成所有已发生业务单据的审核、卖场运营人员停止货物调转并整理好货架。
盘点准备
盘点当天营业结束后，信息部完成当日日结，然后生成立即进行盘点的机构盘点批次，并对该盘点批次进行盘点锁库。
实际盘点
实盘点数过程中商品不要发生营业。
将实际盘点数量录入盘点录入单，可以当前台盘点录入单处录入，也可以在POS前台录入盘点数量，或者使用盘点机。
生成盘点差异
实盘数量全部录入完成后生成盘点差异。
生成漏盘商品
以库存商品为基准生成漏盘商品是指锁库时有库存但实盘录入中没有录入数量的商品。
以商品档案为基准生成漏盘商品是指商品档案中有这个商品但实盘录入中没有录入数量的商品。建议选择以库存商品为基准生成漏盘商品。
打印盘点差异和漏盘商品
在打印盘店差异窗口中选中本次盘点批次号，浏览盘点差异和漏盘商品，并建议打印出来。
复盘
如果有异议，可以针对漏盘商品及盘点有盈亏商品进行复盘。复盘步骤包括确定复盘日期、在复盘日期当日营业结束后信息部完成日结、开始复盘、录入复盘数量、保留并审核复盘录入单、重新生成盘点差异和漏盘。
审核盘点单
盘点录入完后保留并审核。
建议在使用科脉软件进行盘点时，确保所有相关人员都清楚流程，并在盘点前进行充分的准备和沟通，以确保盘点的准确性和效率。