软件服务合同的印花税缴纳方式如下：
在线缴纳
可以通过国家税务局网站进行在线缴税，支持通过网上银行、支付宝等方式支付。
网点缴纳
可以前往当地国家税务局的网点，通过现金或支票等方式缴纳印花税。
银行代扣
在签订软件服务合同时，可以要求银行在支付款项时代扣印花税。
印花税的计算
软件服务合同的印花税按合同金额的万分之三计算。例如，如果合同金额为10万元，则印花税为10万 × 0.0003 = 30元。
缴纳流程
计算印花税：
根据合同金额计算出应缴纳的印花税金额。
购买印花税票：
前往税务局或在线购买印花税票。
贴花：
将印花税票贴在合同的空白处，并确保贴实，然后在印花税票上画贯穿的线，划销。
注意事项
税务局对印花税的缴纳有时间要求，一般需要在合同签订之日起30日内缴纳印花税。
发票等必要的票据应当注明印花税金额，缴纳方的需求和实际付款应与发票相匹配，否则可能会被税务部门认为是避税行为。
建议选择一种便捷的缴纳方式，如在线缴纳或银行代扣，以确保按时完成印花税的缴纳。