使用税控开票软件抵扣增值税的过程如下：
确认纳税人资格：
购买增值税税控系统的纳税人必须是增值税纳税人，即已完成税务登记并正常开展生产经营活动的企业或个体工商户。
索取并核对增值税专用发票：
购买税控系统时，需索取增值税专用发票，并核对开票名称、税号、金额等信息是否与实际相符，以确保后续抵扣的准确性。
发票认证：
企业需通过税控系统导入或扫描增值税专用发票信息，进行电子发票的认证，确保发票的真实性和合法性。
进项税录入：
认证后的发票信息会自动进入系统，需核对无误后，将进项税额录入到系统的抵扣明细表中。
抵扣计算：
系统会自动计算可以抵扣的增值税额，根据企业的销项税与进项税情况，自动进行抵扣计算。
填写申报表：
在每月或每个季度的纳税申报期内，根据税控系统计算的结果，填写增值税纳税申报表的相应栏目。
提交申报：
最后，通过税控系统在线提交申报表，完成增值税的抵扣操作。
税务机关审核：
税务机关会对企业提交的申报表进行审核，确认申报的信息是否真实有效，如发票的真实性、合法性等，审核通过后，企业可以享受抵扣税额的优惠政策。
注意事项：
增值税专用发票必须在申报期限内进行抵扣。
发票认证和抵扣需要严格遵守税法规定，确保所有数据的准确性和合规性。
税控开票软件的使用应遵循相关税法规定，确保操作的正确性和合法性。
通过以上步骤，企业可以顺利完成税控开票软件的增值税抵扣操作。建议在实际操作中，企业应选择可靠的税控系统和服务，确保数据的真实性和完整性，以充分利用抵扣政策，降低税负。