加密EXE文件的方法有多种，以下是几种常用的软件和方法：
易通文件夹锁软件
提供程序锁功能，专门用于加密EXE文件。
超级加密3000
功能强大的文件和文件夹加密和保护软件，支持超快和最强的文件、文件夹加密功能。
EXE一机一码打包加密大师1.5.0
新增了网络验证功能，给EXE文件添加激活码，用户需要输入激活码才能使用软件。支持生成静态激活码（卡密），并可以通过网络直接发送给用户。
文件加密狗
能够对所有类型的文件进行加密，提供一次性密码或每次使用都需要授权的模式。
EXE文件加密器
用于exe文件加密，支持一机一码授权分发，用户必须得到授权才能运行。可以创建开启密码，与用户的电脑硬件绑定，确保文件安全。
UPX Shell
使用UPX工具对EXE文件进行加密压缩，生成UPX壳的加密文件。UPX是一种常用的可执行文件压缩工具，可以提高文件的执行速度，同时也可以用于保护文件不被轻易分析。
WinRAR 和 7-Zip
这两个工具都支持创建加密的压缩文件（如RAR或ZIP），并可以将其转换为自解压的EXE文件。用户需要输入密码才能解压和运行文件。
建议
选择合适的工具：根据你的需求和操作习惯，选择一种或多种合适的加密工具。
测试加密效果：在正式使用前，先对文件进行加密测试，确保加密效果符合预期。
定期更新：使用加密软件时，定期更新软件以获取最新的安全补丁和功能。
通过以上方法，你可以有效地保护EXE文件的安全性，防止未经授权的访问和使用。