在软件著作权侵权纠纷中，被告可以采用以下抗辩手段：
合理来源抗辩
合法渠道：被告需证明其销售、使用或提供的软件产品来源于合法的渠道或供应商，并提供相关的采购合同、交易记录、发票等证据。
合理价格：被告需证明其购买软件时支付了合理的价格，且该价格与市场价格相符。
尽到注意义务：被告需证明在购买、销售或使用软件时，已经尽到了合理的注意义务，包括对软件的著作权状况进行了必要的审查。
合理使用
根据法律的规定，不必经著作权人许可而无偿地使用其作品的行为。
权利人同意
包括权利人明示同意和推定权利人同意，如订立许可使用合同等。
著作权无效
如作品已经过了保护期或依法禁止出版、传播的作品。
时效完成
对权利人主张侵权的经济损失，只能自权利人提起诉讼之日起向前推算两年，超过两年不予保护。
法定许可和强制许可
该使用属于著作权法上规定的法定许可制度和强制许可使用制度。
未达到侵权程度
引用并未达到著作权法规定的抄袭的程度，并注明了引处。
非保护对象
某些软件可能不属于著作权法保护的对象，如法律明确排除的作品类型。
GPL抗辩
被告通过援引GPL许可证，主张其使用涉案软件的行为是合法的，因为涉案软件本身是基于GPL许可证发布的开源软件，被告在使用过程中遵循了GPL许可证的规定。
开源抗辩
包括潜在侵权方基于涉案软件开源特性提出的抗辩，立足于开源许可证的不侵权抗辩。
其他抗辩策略
包括证明原告不是涉案作品的著作权人、涉案作品与侵权作品之间存在相同或相似的情形但不构成侵权、被告尽到了合理的注意义务等。
在实际操作中，被告应根据具体情况选择合适的抗辩手段，并提供充分的证据支持其抗辩理由。建议被告在诉讼过程中积极收集和提供相关证据，以维护自身合法权益。