汽车保护程序应当按以下流程处理：
停车保护现场：
首先，当事人应当立即停车并保护现场，查看车损情况，确保自身和他人的安全。
自行协商处理：
如果事故中当事人对事实及成因无争议，可以即行撤离现场，恢复交通，并自行协商处理损害赔偿事宜。
报警处理：
如果事故中存在争议，当事人应当立即报警，由交警部门到现场进行处理。
现场勘查：
交警部门接到报警后，会迅速到达现场进行勘查，收集证据。
责任认定：
交警部门经过调查后，会根据当事人的行为对发生交通事故所起的作用以及过错的严重程度，确定当事人的责任，并作出责任认定书。
赔偿调解：
根据责任认定书，交警部门会组织双方进行赔偿调解，以达成赔偿协议。
在整个处理过程中，应当遵守相关法律法规，如《刑法》第一百三十三条关于交通肇事罪的规定，以确保处理过程的合法性和公正性。