关联词“虽然…但是”和“虽然…可是”在语法功能上都是用来连接两个分句，表达转折关系。它们的主要区别在于表达的情感色彩和语境适应性：
情感色彩:
“虽然…但是”通常表达一种较为中性的转折，即承认一个事实，但另一个事实与之相对立或不同。
“虽然…可是”有时含有更强烈的主观情感，可能强调说话者内心的不情愿或无奈。
语境适应性:
当转折较为温和，或者前后句子长度差异不大时，可以使用“但是”。
当需要强调主观情绪，或者后接的句子较长、内容较为复杂时，更倾向于使用“可是”。
举例来说：
“虽然下着倾盆大雨，但是我不得不去上学。”
“尽管下着倾盆大雨，可我不得不去上学。”
在这两个句子中，都表达了即便在不利条件下（大雨），说话者还是必须去上学的意思，但第二句通过使用“尽管…可”结构，可能更强调了说话者的不情愿情绪。
需要注意的是，这些关联词的使用有时也受到个人习惯和地域差异的影响，因此并非绝对严格区分。在实际应用中，可以根据语境和所要传达的情感色彩灵活选择使用