两个钻头钻深孔的编程方法如下：
确定工艺要求
根据工件的材料、形状和要求，确定深孔钻的钻削策略、切削参数以及冷却液的使用情况。
创建钻削程序
利用深孔钻床的编程系统，编写钻削程序。程序通常包括初始点设定、钻孔路径设定、进给速度设定、冷却液的喷射等。
数控编程
深孔钻加工通常使用数控机床进行操作，因此编程涉及数控编程技术。程序员需要了解数控系统的基本原理和编程语言，以便正确编写加工程序。
配置加工参数
需要配置一系列的加工参数，包括切削速度、进给速度、冷却液的供应等。这些参数的配置需要根据工件材料和几何形状的特点进行选择。
编写具体钻孔程序
以FANUC系统为例，深孔加工指令格式为G73和G83。G83指令格式为：`G83X--C--Z--R--Q--P--F--K--M--；`，其中：
`X, Z` 为孔底座标，
`C` 角度，
`R` 初始点增量，
`Q` 每次钻深，
`P` 孔底留时间，
`F` 进给量，
`K` 重复次数，
`M` 使用C轴时用。
调试与优化
将编写好的钻削程序上传到深孔钻床，进行调试与优化。检查钻孔的尺寸精度和表面质量，对程序进行修正和优化，以达到要求。
条件设定与机床操作
在深孔钻床上进行编程前，需要进行条件设定，如加工速度、进给速度、刀具的选用等。同时，要掌握深孔钻床的操作技巧，正确使用各种功能键和操作面板。
示例程序
```
G0X8.Z1.C0
G83Z-10.Q3.F0.06C180.G80
G0Z30
```
这个程序首先将钻头移动到初始位置（X=8, Z=1），然后进行深孔钻削，每次钻深3.0mm，进给速度0.06mm/min，冷却液喷射开启，并且使用C轴。完成第一个孔的钻削后，程序取消循环，并将钻头移动到Z=30的位置，准备钻第二个孔。
请根据具体的机床系统和工件要求调整上述程序参数。