计算机二级Java编程题目的分值分配如下：
单项选择题 （含公共基础知识部分）：40分。操作题：
60分（包括基本操作题、简单应用题及综合应用题）。
具体评分步骤如下：
选择题：考生答对单项选择题后，根据题目难度和答题情况给予一定分数，通常每个选择题1分。
操作题：考生需要完成一系列操作题，包括基本操作题、简单应用题和综合应用题。评分时会根据考生编写的代码与标准答案的相符度进行评分，如果完全相同则得满分，否则根据相符度给予相应分数。有些题目可能还需要提交out.dat文件，评分时会将文件内容与标准答案对比，相符度越高得分越高。
建议考生在备考过程中，重点练习操作题，尤其是综合应用题，以提高实际编程能力和应对考试的能力。同时，注意掌握公共基础知识部分，这有助于在选择题中取得好成绩。