工程退款程序可以根据不同的工程背景和退款原因进行定制，但一般应包括以下几个关键步骤：
确认退款金额
双方应明确需要退款的具体金额，并确保金额计算准确无误。
确定退款期限
甲方应在协议签署后的一定工作日内完成退款，以便乙方及时收到款项。
选择退款方式
退款可以通过银行转账、支票、现金等方式进行，需确保双方对退款方式达成一致。
签订退款协议
双方应签订书面的退款协议，明确退款金额、期限、方式等关键条款，并由双方签字盖章确认。
履行退款义务
甲方应按照协议约定的时间和方式将退款款项支付到乙方指定的账户。
记录和确认
双方应对退款过程进行记录，并确保退款完成后的确认工作，以便日后查询和备案。
退款协议
甲乙双方签署工程退款协议书，明确退款金额、期限和方式。
退款金额
甲方同意退回乙方人民币________元整。
退款期限
甲方同意在本协议签署之日起__个工作日内，将退款款项按照乙方提供的账户信息转账到乙方指定账户。
退款原因
详细列出工程未能按照合同要求完工的具体原因，如甲方未能按时提供施工图纸、施工许可证等，或乙方施工质量问题等。
其他条款
如有必要，双方可约定其他相关条款，如违约责任、争议解决方式等。
签署和生效
退款协议由双方签字盖章后生效，双方应各持一份副本。
通过以上步骤，可以确保工程退款程序的顺利进行，并保障双方的合法权益。建议在实际操作中，双方应充分沟通，明确各自的责任和义务，以减少退款过程中的纠纷。