程序违法的举证处理主要涉及以下几个方面：
收集证据
起诉时应准备好相关证据，如违法程序的相关文件、记录等，以证明程序确实存在违法之处。证据包括程序运行记录、相关文件、证人证言、鉴定意见等。
明确起诉主体
一般是受到程序违法影响的当事人或相关权益方。确定起诉的主体有助于明确诉讼对象和范围。
确定起诉法院
根据法律规定的管辖范围选择合适的法院。不同类别的案件可能有不同的管辖法院，选择正确的法院是诉讼成功的关键。
准备起诉材料
包括起诉状、证据等，并按照法院的要求进行提交。起诉状应详细说明诉讼请求、事实和理由，证据应真实、合法、充分。
遵守法律程序和规定
在起诉过程中，要严格遵守法律程序和规定，确保起诉的合法性和有效性。这包括诉讼时效、管辖权、证据规则等。
等待法院审理和判决
提交起诉材料后，等待法院的审理和判决。在审理过程中，当事人有权进行陈述、质证和辩论，以维护自身的合法权益。
上诉和投诉
如果对一审判决或裁定不满，可以在规定期限内向上级法院提起上诉。同时，如果发现法官办案程序违法，可以向上一级法院、纪检或检察院等部门投诉。
承担举证责任
在某些情况下，如被告原因导致原告无法举证，由被告承担举证责任。此外，如果被征收人未对屋内的物品进行清点登记造册，则应承担举证不能的不利后果。
通过以上步骤，当事人可以有效地进行程序违法的举证处理，维护自身的合法权益。建议在实际操作中，咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。