计算机本质上是 按计算机综合性能指标来区分的。计算机综合性能指标包括了计算机的硬件配置、软件功能、运行速度、处理能力等多个方面，是衡量计算机性能优劣的重要依据。
具体来说，计算机可以按照不同的分类标准进行划分：
按体积大小：
可分为巨型机、大中型机、小型机和微型机。
按CPU的集成度：
可分为中央处理器（CPU）高度集成的计算机和CPU集成度较低的计算机。
按存储容量：
可分为具有大容量存储的计算机和存储容量较小的计算机。
但从本质上来讲，计算机的分类更多地是基于其综合性能指标，因为这能够更全面地反映计算机的处理能力、应用范围和效率。因此，选项C“计算机综合性能指标”是计算机分类的本质依据。