生物系统是指 由生物体与生物界不同层次的结构体系组成的统一整体。从系统论的角度来看，生物系统是将生物不同层次的结构体系看做“系统”。生物系统包括生物之间的相互作用和生物与非生物环境的相互作用。
生物系统可以包括多个层次，例如：
细胞：
生物体的基本结构和功能单位。
组织：
由细胞组成，具有特定功能的结构。
器官：
由多种组织组成，完成特定生理功能。
个体：
由多个器官组成，具有完整生命活动的生物实体。
种群：
同一物种的个体在一定空间范围内的集合。
群落：
不同物种的个体在一定空间范围内的集合，形成生态系统的基础。
生态系统：
由生物群落与其非生物环境相互作用形成的统一整体，包括生产者、消费者和分解者。
生物系统的研究有助于我们理解生物之间的相互关系、能量流动和物质循环，以及生态系统的稳定性和可持续性。