指令系统，也称为机器指令集，是指 一台计算机中所有机器指令的集合。它是表征一台计算机性能的重要因素，其格式与功能不仅直接影响到机器的硬件结构，也直接影响到系统软件，以及机器的适用范围。
指令是计算机执行某种操作的命令，是计算机运行的最小功能单位。指令系统是计算机硬件的语言系统，也称为机器语言。从系统结构的角度看，它是系统程序员看到的计算机的主要属性。
不同计算机的指令系统包含的指令种类和数目也不同。一般均包含算术运算型、逻辑运算型、数据传送型、判定和控制型、移位操作型、位（位串）操作型、输入和输出型等指令。指令系统是表征一台计算机性能的重要因素，它的格式与功能不仅直接影响到机器的硬件结构，而且也直接影响到系统软件，影响到机器的适用范围。
在设计指令系统时，需要考虑指令功能、操作类型的设计，寻址方式和指令格式的设计。指令系统的性能决定了计算机的基本功能，它的设计直接关系到计算机的硬件结构和用户的需要。
常见的指令集有：Intel的x86，EM64T，MMX，SSE，SSE2，SSE3，SSSE3 （Super SSE3），SSE4A，SSE4.1，SSE4.2，AVX，AVX2，AVX-512，VMX等指令集；和AMD的x86，x86-64，3D-Now!指令集。