在Proteus仿真程序中，可以使用以下几种编程语言：
VHDL：
VHDL（Very High Speed Integrated Circuit Hardware Description Language）是一种硬件描述语言，用于描述数字电路和系统级电路。通过编写VHDL代码，可以对电路进行功能验证和性能分析。
Arduino：
Arduino是一种开源硬件平台，采用简单易用的编程语言。Proteus中集成了Arduino的编程环境，可以直接在Proteus中编写Arduino代码，并进行仿真测试。
C语言：
Proteus支持C语言编程，可以使用C语言编写仿真的驱动程序、信号处理程序、通信协议、电路控制等。C语言是一种高级编程语言，广泛应用于嵌入式系统的开发中。
Lua脚本：
Proteus还支持使用Lua脚本进行编程。Lua是一种轻量级的脚本语言，适合用于快速原型开发和扩展功能。
ISIS编程语言：
ISIS是Proteus软件中用于设计和模拟电子电路的部分，使用ISIS编程语言（ICL）可以进行脚本编写，实现自动化测试、仿真和电路设计过程的自定义控制。
Ares编程语言：
Ares是Proteus软件中用于PCB设计的部分，可以使用脚本语言进行自定义操作和批处理，实现自动布局、自动布线和自定义规则检查等功能。
VBScript和JavaScript：
Proteus还支持使用VBScript和JavaScript编程语言进行脚本编写。
Assembly语言：
Proteus也支持汇编语言编程，可以使用汇编语言编写代码，特别是对于特定硬件平台的仿真。
选择哪种编程方式取决于具体的应用场景和需求。例如，对于数字电路设计，VHDL是常用的选择；对于快速原型开发和简单电路测试，Arduino和Lua脚本可能更合适；而对于复杂的嵌入式系统或PCB设计，C语言和ISIS编程语言可能更为适用。