租船代理程序通常包括以下几个步骤：
接受委托
租船代理首先接受货主的委托，确认货主在出口地海关的备案情况、报关单据是否齐备、所需证件是否齐全、货物配哪种集装箱以及有无特殊要求等内容。
租船询价
承租人通过租船经纪人或直接发出询价，内容包括货物种类、数量、装卸港口或地点、装卸费用条件、受载期与解约日、租船方式和期限、船型和载重吨、希望采用的租船合同范本等。
租船报价
船舶所有人收到承租人的询价后，进行成本估算或比较其他询价条件，并通过租船经纪人向承租人提出所能提供的船舶情况和运费率或租金率。
实质性谈判
双方就租船条件和运价进行详细讨论和协商，直至达成一致。
签订租船合同
经过谈判，双方签订租船合同，明确双方的权利和义务。
协助履行合同
租船代理在合同签订后，协助双方履行合同，包括船舶申报、靠泊计划的安排、作业收听、与委托方、船方、港方、外勤业务员、收/发货人、口岸检查单位及各业务部门的联系和协调，确保船舶顺利进出港口并完成装卸货作业。
后续工作
包括电子舱单的录入、提单的寄送、核销退税单据的制作等。
整个租船代理程序是一个涉及多方协调、专业知识和市场行情运用的过程，旨在确保租船活动的顺利进行和双方利益的保障。