税务自查补税程序一般包括以下几个步骤：
自查阶段
企业或纳税人对照税法规定，对自己的纳税义务履行情况进行自查自纠，发现少交税款行为予以纠正（补缴税款）。
自查可以由纳税人自觉对照税法规定进行，也可以是在税务机关的通知或指导下进行。
准备补税资料
补缴税款需要提供基本个人资料，如身份证号码、姓名等。
制作补交税的报表，详细列明补缴的税款金额及相关信息。
提交申报报表
将申报报表提交到税务局，由税务局出具通用缴款书。
某些情况下，企业可能需要先提交自查补税书面申请，并到税务征收机关前台申报征收窗口补缴税款。
缴纳税款
根据税务局出具的通用缴款书，到银行进行税款缴纳。
缴税完成后，银行会出具完税证明，一般需要3-5天时间。
后续申报
补税完成后，在下一个申报期内，企业需要在《增值税纳税申报表》等相关报表中填写自查补税的信息，包括自查收入、自查税款等。
审核与检查
税务局会根据企业提交的自查结果和补税情况进行审核，若满意则不再进行进一步检查，若不满意可能会进行税务稽查。
通过以上步骤，企业或纳税人可以完成税务自查补税的程序，及时纠正税收违法行为，并依法避免或减轻相应的法律责任。