初中生办理休学的程序如下：
提出书面申请：
学生或家长需向学校提出书面休学申请。
家长同意：
未成年学生的休学需要得到家长或监护人的书面同意。
学校审核：
学校对休学申请进行审核，确保符合教育部门的相关规定。
健康评估：
如果休学原因涉及健康问题，需提供医疗机构出具的健康评估报告。
提交证明材料：
需要提交相关的证明材料，如病历、医疗费用单据等。
学校出具休学证明：
学校审核同意后，出具加盖公章的休学证明书。
教育局备案：
学校在批准休学后，将休学情况报告至上级教育行政部门备案。
学籍保留：
学校在学生休学期间保留其学籍，直至休学结束或其他处理决定。
复学手续：
学生休学期满后，需要向学校提出复学申请，并按照学校规定办理相关手续。
建议：
办理休学手续时，务必按照学校及教育局的要求准备齐全所有材料，确保申请过程顺畅。
如果休学原因涉及健康问题，一定要提供详细且有效的医疗证明。
休学期间，学生应制定合理的补学计划，确保在复学后能够跟上学习进度。