运行Java程序主要使用以下命令：
javac：
用于编译Java源代码文件，生成.class字节码文件。命令格式为：
```
javac YourProgram.java
```
其中，`YourProgram.java`是你的Java源代码文件名。
java：
用于运行编译后的Java字节码文件。命令格式为：
```
java YourProgram
```
其中，`YourProgram`是你的主类名（没有.java或.class扩展名）。如果主类位于包中，则需要指定包名，例如：
```
java com.example.YourProgram
```
javaw：
与`java`类似，但运行时会隐藏控制台窗口。主要用于运行图形界面的Java程序。命令格式为：
```
javaw YourProgram.jar
```
其中，`YourProgram.jar`是包含主类的JAR文件名。
javah：
用于生成C头文件和stub文件，主要用于本地方法的开发。命令格式为：
```
javah fully-qualified-classname
```
其中，`fully-qualified-classname`是完整限定类名。
建议
确保在运行Java程序前，已经正确安装了Java开发环境（JDK），并且配置了正确的环境变量。
在不同操作系统中，命令的格式可能略有不同，例如在Linux或macOS系统中，路径分隔符是`/`，而在Windows系统中是`\`。
如果项目包含多个JAR文件或依赖库，可以使用`-cp`或`-classpath`选项指定类路径。例如：
```
java -cp lib/*:bin com.example.MainClass
```
其中，`lib/*:bin`表示当前目录下的所有JAR文件和`bin`目录。