农村危房整改补助的申请程序如下：
申请
符合危房改造条件的农户，由户主本人自愿向所在地村民委员会提出书面申请，填报《申请审批表》，并提供户口簿、五保证、低保证、残疾证、建档立卡贫困户帮扶手册、危房照片等有关证明资料。
评议
村委会接到申请后，召开村民大会或村民代表会议进行民主评议，评议人数不得少于村民代表的2/3。议定符合改造条件的对象在村务公开栏予以公示且公示期不少于10天，公示无异议的，上报乡镇政府。
审核
镇（乡）人民政府接到村委会的申报材料后，根据《农村危险房屋鉴定技术导则》，组织人员逐户房屋鉴定和核查。
审批
县级农村危房改造领导小组办公室接到镇（乡）上报的材料后，联合县级相关部门进行身份复核，对符合补助条件的，改造完成后，依程序拨付补助资金。审批结果在村务公开栏张榜公布。
签订协议与领取补助
审批通过后，你将与当地政府签订危房改造协议。这份协议将明确改造的要求、补助的金额以及双方的责任和义务。签订协议后，你可以按照协议要求进行房屋改造。
建议：
确保所有提供的证明材料真实有效，以免影响申请流程。
在申请过程中，保持与村委会、乡镇政府和县级部门的沟通，确保申请进度顺利。