程序不合规的后果取决于具体情况和所涉及的领域。以下是一些可能的后果：
法律后果
行政处罚：例如，公司清算程序不合法可能导致公司受到警告、罚款、暂停运营或永久关闭等处罚。
行政许可撤销：程序瑕疵可能导致行政许可被撤销，尤其是当违反主要程序时。
国家赔偿：在刑事诉讼中，程序违法可能导致受害者获得国家赔偿。
法律诉讼：不合规的程序可能引发法律诉讼，导致经济损失和声誉损害。
运营后果
用户流失：不合规的行为可能导致用户信任度下降，引发用户流失。
合作伙伴关系受损：与合作伙伴的不合规行为可能导致合作关系终止。
市场份额下降：用户流失和合作伙伴关系受损将影响小程序在市场上的份额和盈利能力。
信誉后果
品牌形象受损：不合规的行为容易引发负面评价，损害品牌形象和声誉。
信任危机：破坏用户对平台的信任，导致用户选择其他平台。
审查与纠正
行政复议：程序违法可导致行政复议，上级机关将责令改正并可能给予行政处分。
司法审查：在司法审查中，程序违法可能导致判决撤销或重作。
其他后果
业绩考核影响：程序违法可能对办案人员的业绩考核产生影响。
市场竞争力下降：不合规的小程序在市场竞争中处于不利地位。
综上所述，程序不合规的后果可能涉及法律、运营、信誉等多个方面，严重时可能导致公司关闭、行政许可撤销、国家赔偿等。因此，遵守法律法规和程序规定对于任何组织和个人都至关重要。