包工程开发票的程序如下：
法律依据
根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，所有单位和个人在支付款项时，应当向收款方取得发票。因此，在工程结算完毕后，发包方或业主应向工程承包商或施工方索取发票。
开具发票的流程
申请和领取发票：
施工单位需要向当地税务机关申请领取建筑业发票，并按照税务机关的规定进行管理和使用。
开具发票：
在工程结算完毕后，施工单位根据合同约定的工程款金额，向付款方开具相应的建筑业发票。发票应包含所有必要的详细信息，并确保其真实性和准确性。
交付发票：
施工单位将开具好的发票交付给付款方，付款方在收到发票后应进行核对并确认无误。
税务登记和发票管理
纳税人应到工程所在地的地税局办税服务大厅领取并填写《代开发票申请表》，并提供申请代开发票人的合法身份证件、付款方对建安劳务服务项目、单价、金额等出具的书面确认证明或合同、公司的税务登记证（副本）复印件等资料。
税务机关会根据所提供的资料和税法规定，计算应缴纳的税款，并在完成税款缴纳后开具劳务费发票给个人。
特定情况下的额外步骤
个人分包工程：
个人分包工程开劳务发票时，需要准备必要的资料，包括申请代开发票人的合法身份证件、付款方对劳务的单价、金额等出具的书面确认证明或合同，然后到税务机关申请代开劳务费发票，并缴纳相应的税款。
外经证和税款预缴：
对于安阳市以外的项目，需要先开外经证，填写相关申请表，并将资料发送至公司经办人员，然后进行税款的预缴和完税证明的获取，最后完成发票的开具。
建议
提前规划：在工程开始前，应提前了解并准备好所有必要的发票和税务资料，以确保流程顺利进行。
咨询当地税务机关：在实际操作过程中，建议咨询当地税务机关，以获取最新的税务政策和具体操作指导。
确保资料完整：在申请发票时，务必确保所有资料齐全且准确无误，以避免因资料问题导致发票开具延误。