乡镇干部升副科级需要经过以下步骤：
酝酿提名
由单位主要领导推荐或县里领导提名推荐。
民主测评与组织考察
设定考核条件，由县委组织部派出考核组到单位进行民主测评推荐，组织考察形成拟提拔人选。
部务会研究
初步名单报县委组织部部务会研究，拿出初步名单。
五人小组会讨论
上五人小组会（书记、县长、副书记、组织部长、纪委书记）研究讨论，形成统一意见。
县委常委会通过
将讨论结果上县委常委会，县委常委会通过后进行任职前公示。
任职前公示
公示无异议后，下发任职文件，正式任职。
权力博弈与推荐
乡镇党委书记和县组织部在晋升过程中扮演重要角色，存在权力博弈，但最终决定权在县组织部。
资格审查与民主测评
被推荐者需通过资格审查和民主测评，测评合格后等待上级常委会通过。
综合评比与决定
组织部门对候选人进行综合评比，最终确定提拔人选，并由上级组织部门行文公布。
这些步骤确保了乡镇干部升副科级的公正性和透明度，同时也体现了组织部门在选拔任用干部中的最终审批权。