选择运营小程序的公司时，可以考虑以下几个因素：
公司资质和研发团队
查看公司是否有正规的资质，是否有官网和经常更新的动态，以及是否可以去公司亲自了解。
确认公司是否拥有优秀的技术研发团队，能够提供稳定的小程序开发和运营服务。
功能优势
考察公司的小程序是否功能齐全，特别是营销功能，能否帮助商家实现裂变拉新、促活转化和留存复购。
了解公司是否提供定制化服务，能否根据商家的具体需求进行个性化开发。
售后保障
确认公司是否提供良好的售后服务，包括技术支持和问题解决能力，确保小程序上线后能够及时应对各种问题。
客户案例和口碑
查看公司过往的客户案例，了解其设计风格、功能实现等方面的水平。
参考其他客户的评价和反馈，了解公司的实际合作体验和口碑。
价格
综合考虑公司的服务内容和质量，选择性价比高的公司，避免仅选择低价但服务质量不佳的公司。
基于以上因素，以下是一些值得推荐的运营小程序的公司：
有赞小程序
提供全面的小程序解决方案，包括开发、运营和推广，支持多种行业的小程序开发，拥有自主研发的小程序框架。
微盟小程序
提供小程序开发、运营和推广等服务，支持多种行业的小程序开发。
杰建云
拥有专业的技术团队，能够根据客户需求提供个性化的小程序解决方案，客户反馈良好。
凡科
注重用户体验，致力于打造简洁易用的小程序，并提供良好的售后服务。
Shopify
在小程序开发方面经验丰富，擅长将创意与技术相结合，为客户打造独具特色的小程序。
BigCommerce
开发团队技术精湛，能够快速高效地完成小程序开发工作，并且质量高。
得有店
拥有13+年的互联网产品研发技术与运营经验，提供专业的设计团队和开发团队，功能全面，提供一系列社交营销工具。
增长超人GrowthMan
拥有完整的增长团队，包括营销专家、设计师、产品经理和工程师，帮助多家世界500强企业和大品牌企业完成访客转化客户的目标。
Chop Dawg
专注于为创业公司和新兴企业提供移动应用开发、Web开发、UI/UX设计等服务。
Fingent
提供企业级应用程序开发、Web开发、移动应用开发等服务，拥有深厚的知识和专业知识。
根据以上信息，建议选择有丰富经验和良好口碑的公司，同时结合自己的实际需求和预算，选择最适合自己的合作伙伴。