手机退票的生效时间主要取决于退票时间和方式：
即时到账
如果在发站开车前，特殊情况也可在开车后2小时内，退还全部票价，核收退票费。
在12306网站上购买的车票，如果没有取报销凭证之前，可以直接在12306官网上退票，退票成功之后，车票款会第一时间原路返回到支付账户，基本上都是秒到账的，最晚也不会超过24个小时。
15个工作日内到账
用户一般在十几分钟之内就可以收到系统退还的票钱，但如果遇到登录用户过多时，网页可能会显示系统繁忙，这时是没有邮件和短信提醒的，但登录12306账户会显示退票已完成。
12306退票到账时间一般是24小时之内，最长不超过15个工作日。
退票通常几分钟左右就可以到账，如果遇到特别情况15工作日内也可以退回。
退票成功后，一般会在15个工作日内退款，当然也不排除立刻到账的可能。
特殊情况
如果乘客发现超过15天时间后，依然还是没有到账的情况下，就可以直接咨询铁路官方12306上的客服人员，跟对方说清楚具体的情况，提交退款编号等内容，之后客服就会帮乘客处理。
综上所述，手机退票的生效时间主要取决于退票的具体情况：
即时到账：特殊情况下的2小时内，最晚24小时。
15个工作日内到账：大多数情况下，退票后15个工作日内会到账。
建议：
如果有特殊情况需要尽快到账，建议选择即时到账的方式。
如果时间充裕，可以选择15个工作日到账的方式，以确保退票款顺利到账。