手机停机后，系统自动注销的时间主要取决于用户是否仍有未结清的欠费以及不同运营商的规定。以下是详细情况：
一般规定
手机停机3个月后，系统会自动注销。
如果用户在此期间有任何缴费行为，则可能不会立即进入销号状态，直到所有欠费结清。
特殊规定
部分运营商规定，如果手机连续停机90天且期间没有产生任何缴费行为，则会被主动销号。
中国移动的手机卡如果在停机后60天内没有使用记录和缴费记录，该号码可能会被自动注销，但特殊情况下可能延长至90天。
中国电信的手机卡如果在停机后90天内没有使用记录和缴费记录，同样会被自动注销，注销后进入90天的冷冻期。
中国联通的手机卡则不会自动注销。
风险提示
即使手机停机，用户仍需注意继续产生的费用，如套餐费、月租费等，这些费用会在用户不知情的情况下继续累积。
如果用户未及时结清欠费，可能会被加入黑名单，影响日后的入网和使用。
综上所述，手机停机后通常会在3个月自动注销，但具体时间可能因运营商和用户的具体情况有所不同。建议用户及时结清欠费，避免因欠费而被注销或影响信用记录。